IMHO: contrato - это когда речь идет о договоре вообще, как сделке, отсюда вытекает самостоятельное употребление этого слова, без сочетания с какими-либо определяющими его словами, acordo - это когда имеется в виду какой-то конкретный тип договора, например, venda e contrato de compra, contrato de licença, и т.